我国海拔最低的湖泊是位于新疆吐鲁番盆地的：

正确答案：D

花生十三方法解析

关键词定位。定位关键词'海拔最低的湖泊''吐鲁番盆地'。地理常识：艾丁湖湖面低于海平面约154米，是我国陆地最低点，A正确。博斯腾湖是新疆最大淡水湖，排除B；赛里木湖、喀纳斯湖均为高山湖泊，排除C、D。确认答案为D。

原解析

艾丁湖湖面低于海平面约154米，是我国陆地最低点；吐鲁番盆地也是我国地势最低的盆地。