元代王祯《农书》的重要贡献包括：

正确答案：D

花生十三方法解析

本题用常识判断-关键词定位法（王祯农书）。元代王祯《农书》的重要贡献是系统总结农业机械并绘制农器图谱：农器图谱占全书大半，图文并茂。介绍西方农业、只记水稻、军事著作均与该书内容不符。故选D。

原解析

元代王祯所著《农书》系统总结了农器制造和使用，并绘制了大量农器图谱，这是其重要贡献。因此D项正确。A项涉及军事内容，B项和C项与《农书》记载方式不符。