夏商周断代工程研究的主要课题是：

正确答案：B

花生十三方法解析

用关键词定位法。夏商周断代工程的课题：运用天文、考古、文献等多学科手段，确定夏商周三代的年代框架（如武王克商之年），B正确。挖掘全部帝陵、复原上古语言、统计古代人口均非该工程主题，排除A、C、D。确认答案为B。

原解析

夏商周断代工程采用多学科方法，主要课题是确定三代年代框架。选项B符合。A项发掘帝陵、C项复原神话、D项统计户籍均与断代无关，故B正确。