1999年澳门回归时中国政府恢复行使主权的依据方针是：

正确答案：D

花生十三方法解析

本题用常识判断-高频考点定位（国家统一）。1999年12月20日我国对澳门恢复行使主权，依据的是一国两制方针，设立澳门特别行政区，实行澳人治澳、高度自治，A项。全面直辖、特区独立、联邦制均与一国两制的宪制安排不符。故选D。

原解析

澳门回归依据“一国两制”方针，即在统一国家内，澳门实行资本主义制度，保持高度自治。B、C、A均不符合“一国两制”原则，C项“独立”错误，A项“联邦制”不适用于中国单一制国家结构。