我国实行的民族区域自治制度是指：

正确答案：B

花生十三方法解析

本题用常识判断-关键词定位法（基本政治制度）。民族区域自治的定义要素是"国家统一领导+少数民族聚居地方+设自治机关行使自治权"，层级为自治区、自治州、自治县。A的分别独立建国违背国家统一，C取消地方政府、D限于城市均与制度内容不符。故选B。

原解析

民族区域自治制度是在国家统一领导下，在少数民族聚居的地方设立自治区、自治州、自治县，设立自治机关行使自治权。故选B。